More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4490 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 890 aa  890    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 890 aa  890    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  46.03 
 
 		 943 aa  750    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 883 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  83.94 
 
 		 846 aa  1354    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 882 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 		 892 aa  821    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  65.26 
 
 		 880 aa  875    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  63.71 
 
 		 868 aa  771    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  64.07 
 
 		 964 aa  795    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  57.86 
 
 		 920 aa  768    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  61.72 
 
 		 889 aa  839    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 959 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  70.47 
 
 		 885 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 841 aa  1684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  61.17 
 
 		 953 aa  732    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  65.32 
 
 		 880 aa  879    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 898 aa  902    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  63.11 
 
 		 975 aa  787    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  64.17 
 
 		 868 aa  818    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  98.69 
 
 		 841 aa  1659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 		 908 aa  758    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  63.24 
 
 		 904 aa  785    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  63.11 
 
 		 975 aa  787    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  63.11 
 
 		 975 aa  787    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  63.26 
 
 		 966 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  59.91 
 
 		 922 aa  771    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  62.25 
 
 		 948 aa  759    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  62.95 
 
 		 975 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 		 845 aa  876    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  90.5 
 
 		 837 aa  1449    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 884 aa  889    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  84 
 
 		 843 aa  1330    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  62.3 
 
 		 972 aa  789    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  64.66 
 
 		 898 aa  832    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  69.31 
 
 		 896 aa  863    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  68.4 
 
 		 885 aa  869    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  60.52 
 
 		 992 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 884 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  61.23 
 
 		 896 aa  873    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 818 aa  806    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  87.05 
 
 		 828 aa  1150    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  63.68 
 
 		 890 aa  749    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 890 aa  890    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  58.31 
 
 		 990 aa  712    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 876 aa  794    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  63.25 
 
 		 969 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  60.8 
 
 		 971 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  60.49 
 
 		 976 aa  787    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  59.03 
 
 		 892 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 890 aa  891    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 895 aa  902    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  60.46 
 
 		 978 aa  725    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  66.22 
 
 		 908 aa  782    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 816 aa  867    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.98 
 
 		 907 aa  848    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  60.39 
 
 		 968 aa  737    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 989 aa  795    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  68.56 
 
 		 884 aa  854    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 890 aa  890    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  58.45 
 
 		 843 aa  912    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 894 aa  904    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 		 908 aa  758    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  62.11 
 
 		 979 aa  778    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  61.72 
 
 		 880 aa  764    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  58.4 
 
 		 854 aa  971    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 835 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  61.11 
 
 		 905 aa  742    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  60.8 
 
 		 971 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  65.26 
 
 		 880 aa  875    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  64.91 
 
 		 869 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  65.26 
 
 		 880 aa  875    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  84.22 
 
 		 842 aa  1331    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  81.4 
 
 		 837 aa  1258    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  46.89 
 
 		 990 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  67.51 
 
 		 831 aa  813    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  70.13 
 
 		 885 aa  868    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  70.13 
 
 		 885 aa  868    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  62.69 
 
 		 883 aa  771    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  55.62 
 
 		 881 aa  906    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  46.62 
 
 		 964 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 890 aa  890    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  61.93 
 
 		 971 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  81.07 
 
 		 840 aa  1252    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  63.11 
 
 		 975 aa  787    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  62.95 
 
 		 975 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  59.31 
 
 		 943 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  62.95 
 
 		 975 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  60.8 
 
 		 971 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  62.18 
 
 		 991 aa  744    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.95 
 
 		 949 aa  663    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  70.3 
 
 		 889 aa  872    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  83.83 
 
 		 846 aa  1352    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  59.03 
 
 		 892 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.22 
 
 		 921 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  64.72 
 
 		 894 aa  865    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 		 803 aa  868    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  70.13 
 
 		 882 aa  873    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 880 aa  913    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 848 aa  857    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>