280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6248 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  889  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  56.68 
 
 
433 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.65 
 
 
432 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  47.22 
 
 
430 aa  440  1e-122  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.99 
 
 
444 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  49.2 
 
 
442 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  44.87 
 
 
440 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  43.12 
 
 
443 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  46.28 
 
 
444 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  42.24 
 
 
436 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  46.47 
 
 
472 aa  355  6e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  45.02 
 
 
442 aa  352  9e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  47.58 
 
 
437 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  40.41 
 
 
457 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  40.41 
 
 
457 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  41.86 
 
 
452 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  44.42 
 
 
438 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  43.41 
 
 
432 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  43.15 
 
 
462 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  42.06 
 
 
468 aa  315  1e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  44.42 
 
 
438 aa  310  3e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  41.09 
 
 
432 aa  310  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 
440 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.88 
 
 
435 aa  308  2e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  43.23 
 
 
438 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  42.52 
 
 
438 aa  305  9e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  38.79 
 
 
464 aa  304  2e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.45 
 
 
454 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 
447 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.95 
 
 
433 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  40.77 
 
 
452 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  41.65 
 
 
436 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  41.78 
 
 
444 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.71 
 
 
437 aa  292  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  42 
 
 
432 aa  285  1e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.85 
 
 
433 aa  283  5e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 
481 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  36.63 
 
 
474 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.92 
 
 
453 aa  255  1e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  38.84 
 
 
455 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.72 
 
 
425 aa  253  7e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  36.02 
 
 
456 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  36.83 
 
 
461 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
456 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
456 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.98 
 
 
463 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 
476 aa  249  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 
441 aa  244  2e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.16 
 
 
472 aa  243  4e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.07 
 
 
431 aa  197  2e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31.59 
 
 
431 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.86 
 
 
445 aa  166  6e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  34.15 
 
 
475 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  23.23 
 
 
478 aa  82  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  33.88 
 
 
478 aa  79.3  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 
490 aa  79.3  1e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.41 
 
 
478 aa  79.3  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  34.07 
 
 
578 aa  78.6  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  33.06 
 
 
471 aa  77.8  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.49 
 
 
478 aa  77.4  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.06 
 
 
478 aa  77.4  5e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.06 
 
 
468 aa  77  6e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  33.06 
 
 
478 aa  76.6  9e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.75 
 
 
437 aa  76.3  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  33.06 
 
 
471 aa  76.3  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 
441 aa  75.5  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  34.32 
 
 
469 aa  73.9  5e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 
446 aa  73.9  5e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  25.52 
 
 
437 aa  72.8  1e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 
418 aa  72.4  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  25.12 
 
 
761 aa  70.5  6e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  29 
 
 
441 aa  68.9  1e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  21.48 
 
 
464 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  39.6 
 
 
437 aa  68.2  3e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  23.09 
 
 
447 aa  65.9  1e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.76 
 
 
429 aa  64.7  3e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  21.87 
 
 
473 aa  63.5  6e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  28.67 
 
 
481 aa  63.5  6e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  22.12 
 
 
464 aa  63.5  7e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.38 
 
 
425 aa  62.8  1e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  36 
 
 
481 aa  62.8  1e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 
424 aa  62  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.03 
 
 
438 aa  62.4  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  1.56043e-06 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.47 
 
 
436 aa  61.6  3e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  21.92 
 
 
434 aa  60.8  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.12 
 
 
483 aa  59.7  9e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  23.28 
 
 
470 aa  58.9  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  27.49 
 
 
437 aa  58.9  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 
378 aa  58.5  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  29.81 
 
 
574 aa  58.9  2e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  21.63 
 
 
442 aa  57.8  3e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.91 
 
 
376 aa  58.2  3e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  22.49 
 
 
433 aa  58.2  3e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 
417 aa  57.4  5e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  32 
 
 
495 aa  57  6e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 
484 aa  55.5  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  26.54 
 
 
432 aa  55.5  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.93 
 
 
464 aa  55.5  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  21.32 
 
 
428 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  22.92 
 
 
452 aa  55.5  2e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>