More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0075 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  47.19 
 
 
676 aa  644  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  78.78 
 
 
661 aa  1085  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  84.72 
 
 
661 aa  1156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  75.57 
 
 
659 aa  1046  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  78.78 
 
 
661 aa  1092  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.54 
 
 
680 aa  636  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  100 
 
 
658 aa  1354  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  52.51 
 
 
611 aa  659  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  64.23 
 
 
655 aa  859  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  49.56 
 
 
673 aa  656  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  57.79 
 
 
683 aa  775  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  52.53 
 
 
777 aa  754  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  47.04 
 
 
676 aa  642  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  50.89 
 
 
806 aa  742  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  49.77 
 
 
673 aa  656  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  47.44 
 
 
670 aa  628  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  48.16 
 
 
686 aa  612  1e-174  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  44.63 
 
 
708 aa  615  1e-174  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.14 
 
 
663 aa  611  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  47.79 
 
 
661 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  46.57 
 
 
659 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  60.67 
 
 
580 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  61.1 
 
 
675 aa  591  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  3.0221e-05  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  42.82 
 
 
725 aa  582  1e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  42.93 
 
 
728 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.82 
 
 
676 aa  573  1e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  45.29 
 
 
675 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  43.66 
 
 
675 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  53.69 
 
 
607 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.46 
 
 
644 aa  516  1e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  40.23 
 
 
709 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52.83 
 
 
586 aa  500  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  40.63 
 
 
677 aa  482  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  49.58 
 
 
583 aa  471  1e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  35.72 
 
 
783 aa  462  1e-128  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  47.79 
 
 
569 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  39.09 
 
 
710 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 
787 aa  441  1e-122  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  35.46 
 
 
793 aa  442  1e-122  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  35.55 
 
 
794 aa  440  1e-122  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  35.56 
 
 
829 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  36.05 
 
 
691 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  37.37 
 
 
636 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  44.24 
 
 
587 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  45.11 
 
 
592 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  44.12 
 
 
589 aa  410  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  37.59 
 
 
647 aa  407  1e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  41.94 
 
 
793 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  41.1 
 
 
778 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  34.46 
 
 
725 aa  379  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  41.88 
 
 
763 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  42.45 
 
 
608 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  40.21 
 
 
790 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  50.53 
 
 
371 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  45.06 
 
 
552 aa  333  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38.75 
 
 
799 aa  319  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  46.1 
 
 
316 aa  271  3e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  31.43 
 
 
697 aa  214  6e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.45 
 
 
633 aa  200  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.89 
 
 
587 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  29.54 
 
 
574 aa  181  3e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.66 
 
 
822 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 
574 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  29.63 
 
 
574 aa  175  2e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  57.33 
 
 
356 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 
495 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.82 
 
 
523 aa  168  3e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  28.14 
 
 
505 aa  168  3e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.82 
 
 
508 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  32.78 
 
 
585 aa  167  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 
498 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.91 
 
 
815 aa  157  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.96 
 
 
814 aa  156  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.32 
 
 
504 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.52 
 
 
505 aa  150  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  25.83 
 
 
527 aa  150  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.98 
 
 
496 aa  149  1e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.93 
 
 
499 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  25.62 
 
 
908 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  8.03096e-14 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  25.86 
 
 
891 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.76 
 
 
808 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.04 
 
 
522 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 
516 aa  143  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  25.49 
 
 
526 aa  142  2e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  27.02 
 
 
505 aa  142  2e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  27.07 
 
 
529 aa  142  2e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  27.54 
 
 
517 aa  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.09 
 
 
499 aa  140  5e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  27.14 
 
 
496 aa  140  5e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  25.79 
 
 
799 aa  140  5e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.21 
 
 
508 aa  140  5e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.99 
 
 
498 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  1.57011e-11 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  24.39 
 
 
523 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 
520 aa  140  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.79 
 
 
816 aa  138  3e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25 
 
 
510 aa  138  4e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  25.38 
 
 
506 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 
530 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.25 
 
 
500 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 
530 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>