277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4155 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  819    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  86 
 
 		 411 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  40.34 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  39.64 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.67 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.69 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.99 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  30.73 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  30.17 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  28.11 
 
 		 495 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  28.57 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  32.96 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  31.3 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  27.86 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  28.44 
 
 		 628 aa  94  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  31.02 
 
 		 466 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  30.91 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 		 470 aa  86.7  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  32.94 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.51 
 
 		 657 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  32.17 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  32.55 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  32.09 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  33.7 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  25.4 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.21 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  33.78 
 
 		 1199 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  34.15 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  29.41 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  29.89 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  32.12 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  27.74 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  29.8 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.94 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  23.25 
 
 		 999 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  29.04 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  27.69 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.99 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.84 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  26.38 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.8 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  28.71 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.58 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  33.88 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  27.31 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  26.3 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.84 
 
 		 625 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  29.58 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  24.83 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.07 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.58 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  29.62 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  29.86 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  27.42 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  26.93 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  27.52 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.76 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  31.15 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  48.48 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  50.88 
 
 		 537 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  25.83 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  25.83 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  27.99 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  27.18 
 
 		 616 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  51.79 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  26.67 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.86 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.73 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  27.09 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  60 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  39.77 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  30.94 
 
 		 1274 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.86 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  49.25 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  40.98 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.97 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  47.06 
 
 		 485 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  47.06 
 
 		 492 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  27.13 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  22.75 
 
 		 510 aa  53.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  27.91 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  27.46 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  43.86 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  38.2 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  58.14 
 
 		 531 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  37.63 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.25 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  28.28 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  24.93 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  40 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  54.72 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  28.63 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  32.76 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  22.94 
 
 		 527 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  26.16 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  41.94 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  38.1 
 
 		 549 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  36.28 
 
 		 498 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>