141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0136 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  100 
 
 		 350 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  96.29 
 
 		 350 aa  694    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  51.71 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  50.28 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  53.06 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  49.13 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  48.22 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  46.63 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  47.32 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10081  tRNA 2-selenouridine synthase  46.63 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.741819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  40.62 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  43.14 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  41.12 
 
 		 339 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  37.9 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  36.22 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  40.74 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  35.74 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  35 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  35.56 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  33.03 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  32.66 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  34.67 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  33.13 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  34.32 
 
 		 375 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  38.29 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  33.77 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  33.23 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  34.02 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  33.44 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  31.56 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  34 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  32.92 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14782  predicted protein  29.88 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.597893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  33.67 
 
 		 342 aa  167  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  33.67 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  31.73 
 
 		 367 aa  165  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  35.31 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3619  tRNA 2-selenouridine synthase  31.44 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  32.21 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  30.12 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  33.44 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  32.07 
 
 		 374 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0285  tRNA 2-selenouridine synthase  31.66 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  36.36 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  33.01 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  31.63 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  36.36 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  31.63 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  33.78 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0863  tRNA 2-selenouridine synthase  32.96 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  34 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  32.78 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  35.34 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  32.12 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  36.14 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10242  predicted protein  32.89 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  31.79 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3754  tRNA 2-selenouridine synthase  33.24 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0900033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  31.79 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  33.78 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0849  tRNA 2-selenouridine synthase  32.3 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0822  tRNA 2-selenouridine synthase  32.3 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5476  tRNA 2-selenouridine synthase  34.31 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361534 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0523  tRNA 2-selenouridine synthase  35.2 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  34.94 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  32.58 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  32.4 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  32.01 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  30.59 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  35.77 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1304  tRNA 2-selenouridine synthase  34.81 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4364  tRNA 2-selenouridine synthase  32.6 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307655  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  34.94 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1622  tRNA 2-selenouridine synthase  31.42 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  31.35 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  32.79 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  32.44 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  29.89 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  32.37 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  31.5 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  31.81 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  33.46 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  29.97 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  34.94 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  34.54 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  34.54 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  32.57 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0142  tRNA 2-selenouridine synthase  30.56 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  35.48 
 
 		 353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  34.68 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  31.4 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  31.19 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  30.66 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  31.75 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  31.6 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2454  tRNA 2-selenouridine synthase  29.72 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  32.44 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  32.68 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  30.06 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>