71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84214 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  44.28 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  28.79 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.46 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.29 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  26.29 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.29 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  27.01 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  26.37 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.37 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.37 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.78 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.77 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  27.32 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.78 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  25.21 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  26 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.13 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.28 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  25.13 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.28 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  29.55 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  24.74 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.67 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.24 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.52 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.35 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  24.23 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  30.53 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  26.18 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.65 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.42 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.62 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  25.77 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  26.5 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.37 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  22.89 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  25.52 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  28.24 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  21.65 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  24.66 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  23.88 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.74 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.37 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  27.48 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.76 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.24 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  23.61 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.39 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  23.12 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  25 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  25.41 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  24.88 
 
 		 188 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  23.88 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.74 
 
 		 217 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.44 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  20.5 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  22.62 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  22.62 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.69 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.69 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  22.44 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>