More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28497 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  40.5 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  40.37 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 		 270 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.25 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  42.32 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.08 
 
 		 967 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.71 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  38.39 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  32.5 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.11 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2500  enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 		 288 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.85 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.42 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30193  enoyl CoA hydratase  30.38 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.62 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.26 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.38 
 
 		 657 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.14 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  30.67 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.07 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  27.64 
 
 		 651 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.14 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.32 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.19 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  32.24 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.48 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.53 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  29.26 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.12 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>