More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2483 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 317 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  94.01 
 
 		 326 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  70 
 
 		 371 aa  427  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  71.43 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  63.55 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  60.67 
 
 		 344 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  49.83 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  44.01 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  45.48 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  45.48 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  44.86 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  39.94 
 
 		 345 aa  254  9e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  40.19 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  34 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  36.45 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  36.82 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  35.66 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  34.08 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  35.22 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  36.49 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  32.9 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  32.9 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  32.9 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.29 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  35.46 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.05 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.69 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  30.15 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  34.16 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  32.97 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.25 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.22 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  33.85 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  31.77 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.19 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  34.34 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  32.18 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  32.18 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  30.65 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  39.02 
 
 		 494 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  32.85 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.58 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.58 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.58 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.58 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.58 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  34.91 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>