More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3164 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 318 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  64.05 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  62.34 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  58.33 
 
 		 317 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  56.83 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  55.52 
 
 		 320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.39 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  52.12 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  46.98 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  49.19 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  45.81 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  42.01 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  41.07 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  35.22 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  38.61 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  36.39 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  32.03 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  30.39 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  33.22 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.7 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  30.95 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.06 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.16 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.51 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  35.23 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.74 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.67 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.21 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  34.3 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.33 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.03 
 
 		 589 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.52 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  33.55 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  31.84 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.4 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.09 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.06 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  31.84 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.6 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  31.84 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.1 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.91 
 
 		 359 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.7 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.7 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.64 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  35.79 
 
 		 360 aa  92.4  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  35.79 
 
 		 360 aa  92.4  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.19 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  31.63 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.58 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  30.22 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.36 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.17 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.3 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.07 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  30.97 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.03 
 
 		 520 aa  89  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.88 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.1 
 
 		 550 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  35.23 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  35.23 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.08 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  31.25 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.71 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.34 
 
 		 578 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  35.23 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  33.15 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.83 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.47 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.14 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.98 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.98 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.41 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.04 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  32.57 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  34.09 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  32.34 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.72 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.14 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.35 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  34.09 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  32.86 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.93 
 
 		 611 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.32 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  30.32 
 
 		 559 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>