More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  95.21 
 
 		 313 aa  584  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  68.37 
 
 		 313 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  71.15 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  70.68 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  70.49 
 
 		 321 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  70 
 
 		 308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  66.45 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  68.17 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  64.54 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  58.58 
 
 		 310 aa  387  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  58.25 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  57.05 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  56.56 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  52.58 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  50.84 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  49.65 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  49.65 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  49.65 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  49.65 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  49.31 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  45.49 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  48.8 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  48.45 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  48.2 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  47.78 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  52.4 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  48.89 
 
 		 319 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  51.01 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  49.14 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  48.57 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  47.92 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  42.61 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  47.27 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  45.71 
 
 		 319 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  44.92 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  40.84 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  39.87 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  35.09 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  33.65 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  31.15 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.65 
 
 		 400 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.5 
 
 		 396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.39 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  34.23 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  33.24 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  34.24 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  34.24 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  33.94 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  35.64 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.71 
 
 		 711 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  29.75 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  33.96 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 		 402 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  32.34 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  29.15 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.29 
 
 		 711 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  29.53 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  30.66 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  32.35 
 
 		 560 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  32.18 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  33.81 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  32.18 
 
 		 397 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.47 
 
 		 398 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.95 
 
 		 712 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  31.63 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  31.63 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  31.63 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  27.92 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  38.89 
 
 		 397 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.12 
 
 		 709 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  28.17 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.92 
 
 		 708 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.16 
 
 		 709 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.5 
 
 		 711 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  34.72 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.16 
 
 		 709 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.89 
 
 		 397 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.51 
 
 		 712 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  39.63 
 
 		 392 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  34.41 
 
 		 412 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.36 
 
 		 389 aa  99  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  31.08 
 
 		 706 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.08 
 
 		 707 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  31.79 
 
 		 409 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  33.68 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  34.72 
 
 		 404 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  42.45 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  30.7 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.77 
 
 		 711 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  31.05 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.03 
 
 		 713 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.03 
 
 		 713 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  27.37 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.68 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  32.57 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.37 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.5 
 
 		 711 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.8 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>