More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17141 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  95.1 
 
 		 143 aa  286  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  94.41 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  93.71 
 
 		 143 aa  283  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  78.87 
 
 		 170 aa  247  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  75.18 
 
 		 150 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  75.18 
 
 		 150 aa  239  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  76.55 
 
 		 150 aa  237  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  76.55 
 
 		 150 aa  237  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  74.47 
 
 		 150 aa  237  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  75.35 
 
 		 151 aa  230  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  73.76 
 
 		 151 aa  227  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  73.76 
 
 		 151 aa  227  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 151 aa  217  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  68.57 
 
 		 151 aa  205  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  68.09 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  63.31 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  64.89 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  64.89 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 149 aa  182  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.09 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  60.63 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 149 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.82 
 
 		 145 aa  175  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 151 aa  175  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>