More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02841 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  74.57 
 
 		 423 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  74.33 
 
 		 423 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  74.75 
 
 		 411 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  78.31 
 
 		 424 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  74.75 
 
 		 411 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 416 aa  863    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  76.46 
 
 		 429 aa  676    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  76.7 
 
 		 431 aa  684    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  74.08 
 
 		 423 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 		 427 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  74.82 
 
 		 423 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  72.52 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 		 427 aa  621  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  72.52 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 		 426 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 		 425 aa  617  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  71.39 
 
 		 427 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  72.12 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 416 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  57.89 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  59.5 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 438 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 416 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 431 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  56.06 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  57.53 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  56.54 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 412 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>