More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4426 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4426  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  37.62 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  36.79 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 140 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 390 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  30.93 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 745 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 745 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  32.71 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  34.65 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.53 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  34.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  34.04 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 686 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 686 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  33.02 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3580  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.66 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  36.7 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  31.25 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  25.74 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  32.35 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.63 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  36.52 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  36.52 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>