263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0460 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2713  putative signal transduction protein  43.18 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.62 
 
 		 524 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  34.18 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  37.44 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  33.01 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  32.08 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.96 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  33.89 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25.83 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  24.77 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.38 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  32.04 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  27.96 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.42 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.92 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.98 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  23.86 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  25.52 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  23.38 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 544 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.84 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  23.86 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  31.43 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.37 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.07 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  23.65 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  23.66 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.11 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  21.57 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.34 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  23.9 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  25.55 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  23.53 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  25.36 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  23.12 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  22.22 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  21.36 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  23.56 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  23.31 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  23.4 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  24.24 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.15 
 
 		 716 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.01 
 
 		 496 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  23.71 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  30.94 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  22.46 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  27.98 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  22.34 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  21.63 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1912  hypothetical protein  32.5 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  0.293367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  22.33 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  24.15 
 
 		 415 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 395 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  22.34 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 350 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>