72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1912 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1912  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  554  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  0.293367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  25.82 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  36.55 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  35.17 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
395 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  22.89 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  28.43 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
395 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  32.5 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  25.49 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  32.1 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.28 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.89 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  25.44 
 
 
346 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  25.44 
 
 
346 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  25 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  25.44 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  26.79 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  27.21 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0032  putative signal transduction protein  23.42 
 
 
345 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  24.62 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.56 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  31.53 
 
 
332 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 
350 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  26.23 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
280 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  32.48 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  24.89 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  26.02 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  29.17 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  32.48 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  28.02 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0215  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0345  hypothetical protein  32.87 
 
 
399 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  24.02 
 
 
347 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  24.02 
 
 
347 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0239  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
412 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  24.85 
 
 
281 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  24.02 
 
 
347 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  31.67 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0230  putative signal transduction protein  33.77 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.14 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  33.07 
 
 
456 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
278 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.57 
 
 
730 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03470  hypothetical protein  33.77 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.20054e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.64 
 
 
524 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.95 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4372  putative signal transduction protein  33.99 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
406 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
544 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.71 
 
 
716 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  27.03 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  28.3 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.35 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  27.78 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.66 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.64 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  23.15 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  23.15 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4997  putative signal transduction protein  32.47 
 
 
420 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720845  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.43 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  27.56 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>