More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4807 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  100 
 
 		 402 aa  783    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 		 780 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  29.34 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  29.63 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  29.51 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  29.83 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  29.97 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  29.36 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  29.62 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  29.3 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  28.76 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  29.25 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  28.61 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  26.92 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  26.87 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  29.04 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  26.85 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  29.11 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  24.63 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  28.72 
 
 		 491 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  25 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  24.56 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  26.55 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  24.61 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  26.55 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.05 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  34.95 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.12 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.04 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  26.02 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  34.41 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.8 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  23.33 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.22 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  23.08 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  27.45 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  22.77 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  23.41 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  23.11 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  24.76 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.15 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  31.12 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  23.18 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  25.51 
 
 		 927 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.91 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  23.82 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  22.44 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  28.39 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.05 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  25.95 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>