More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3905 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  64.41 
 
 
223 aa  286  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  61.09 
 
 
255 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  57.08 
 
 
239 aa  251  9e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  55.56 
 
 
233 aa  244  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  54.67 
 
 
234 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  54.22 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  53.3 
 
 
233 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  53.3 
 
 
233 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  53.3 
 
 
233 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  53.85 
 
 
233 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  49.32 
 
 
239 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
269 aa  189  3e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  44.1 
 
 
247 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  46.67 
 
 
237 aa  166  3e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  43.21 
 
 
244 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  41.74 
 
 
252 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  42.48 
 
 
252 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
255 aa  154  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  1.69252e-07 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
240 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  40.91 
 
 
253 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  40.83 
 
 
250 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 
258 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
265 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
251 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 
240 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  35.45 
 
 
244 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.92 
 
 
258 aa  134  2e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  41.55 
 
 
231 aa  134  2e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  36.74 
 
 
244 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  37.44 
 
 
246 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.92 
 
 
258 aa  132  4e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  36.28 
 
 
244 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  37.16 
 
 
260 aa  131  8e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
243 aa  131  8e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  38.97 
 
 
240 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  38.97 
 
 
240 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.76 
 
 
259 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.62 
 
 
258 aa  131  1e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 
252 aa  130  2e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.23 
 
 
258 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  35.07 
 
 
245 aa  128  7e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 
253 aa  127  2e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
235 aa  127  2e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  40.38 
 
 
247 aa  127  2e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  41.44 
 
 
286 aa  127  2e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.78 
 
 
258 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.83 
 
 
258 aa  125  4e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
245 aa  126  4e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.65 
 
 
258 aa  125  4e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
253 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  34.08 
 
 
255 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
251 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.65 
 
 
258 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
256 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  34.35 
 
 
239 aa  125  8e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3660  GntR-like  36.15 
 
 
245 aa  125  8e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 
245 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01468  putative regulatory protein, GntR family  37.22 
 
 
243 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  35.09 
 
 
268 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.90412e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  35.11 
 
 
249 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  35.11 
 
 
249 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  35.11 
 
 
249 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  35.11 
 
 
249 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.59 
 
 
264 aa  121  1e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.40199e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.59 
 
 
264 aa  121  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.98725e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.59 
 
 
264 aa  121  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 
253 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  34.08 
 
 
255 aa  120  2e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.27 
 
 
257 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.27 
 
 
257 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.27 
 
 
257 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.27 
 
 
257 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.27 
 
 
257 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 
239 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.63165e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 
253 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  34.08 
 
 
255 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  34.31 
 
 
255 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  34.31 
 
 
255 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  34.31 
 
 
255 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.53 
 
 
257 aa  117  2e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.98 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  34.98 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.36 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.36 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.36 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.36 
 
 
257 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  34.98 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  34.98 
 
 
257 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
256 aa  115  4e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  32.33 
 
 
255 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
252 aa  115  7e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
249 aa  114  1e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0570986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>