More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0510 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
353 aa  717    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  38.92 
 
 
345 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  36.2 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.56 
 
 
363 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  37.76 
 
 
348 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  35.26 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  36.57 
 
 
380 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  38.8 
 
 
351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  34.35 
 
 
339 aa  215  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  39.56 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 
350 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.86 
 
 
343 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  33.65 
 
 
335 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  33.62 
 
 
366 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  32.24 
 
 
309 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  34.64 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.54 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  37.54 
 
 
336 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  33.14 
 
 
361 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  37.29 
 
 
386 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 
317 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  30.67 
 
 
328 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  32.45 
 
 
315 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.03 
 
 
336 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  36.72 
 
 
336 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  34.04 
 
 
330 aa  185  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.95 
 
 
336 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  33.74 
 
 
339 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  37.82 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  32.82 
 
 
371 aa  182  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  28.14 
 
 
358 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35.91 
 
 
331 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  33.75 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  30.5 
 
 
369 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.04 
 
 
297 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  38.52 
 
 
349 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  38.52 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.41 
 
 
339 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 
353 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  36.54 
 
 
343 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 
323 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  34.54 
 
 
333 aa  169  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.08 
 
 
306 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  33.66 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  30.54 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  34.32 
 
 
362 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  32.01 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  34.41 
 
 
350 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  36.26 
 
 
326 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 
320 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  30.64 
 
 
312 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 
346 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 
346 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  36.84 
 
 
350 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  32.42 
 
 
340 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  34.64 
 
 
355 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.99 
 
 
349 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  33.54 
 
 
335 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.15 
 
 
308 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 
321 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 
308 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.14 
 
 
313 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  35.62 
 
 
306 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  33.76 
 
 
344 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 
323 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  36.96 
 
 
344 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.51 
 
 
337 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.23 
 
 
361 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  33 
 
 
340 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  31.56 
 
 
344 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.44 
 
 
357 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  37.14 
 
 
301 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  36.79 
 
 
301 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 
341 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  35.61 
 
 
308 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  33.23 
 
 
341 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  35.4 
 
 
300 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  34.29 
 
 
350 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  36.79 
 
 
301 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 
344 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.49 
 
 
350 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  35.04 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  34.09 
 
 
322 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  33.44 
 
 
344 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
338 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.27 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  31.41 
 
 
349 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  29.97 
 
 
305 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  33.9 
 
 
338 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  31.55 
 
 
370 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 
367 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  33.33 
 
 
345 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
359 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.55 
 
 
308 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  32.96 
 
 
305 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 
312 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>