More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3944 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  326  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  52.38 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  49.04 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  47.65 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.06 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  46.63 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  42.24 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  44.6 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.9 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  43.06 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  43.42 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  40.29 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 153 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 156 aa  91.3  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2178  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  29.05 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.77 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  35.66 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.7 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  31.08 
 
 		 229 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.41 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>