More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3209 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.37 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  40 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  35.96 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  35.38 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.38 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.38 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  34.51 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  31.86 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  29.6 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  41.05 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.03 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  40 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  31.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  31.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.03 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.08 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  32.74 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.89 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  31.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2138  MutT/NUDIX family mutator protein  31.86 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.08 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  34.23 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  40.21 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  30.25 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  47.14 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.48 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.79 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.79 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.79 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.23 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  34.88 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.19 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  32.14 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  32.74 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  39.18 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  29.6 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.74 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  39.18 
 
 		 334 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.21 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.41 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  29.79 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.41 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>