More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2927 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  43.18 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  43.18 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.48 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  44.57 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  50 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  41.76 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  44.05 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  45.95 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.76 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  42.67 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.33 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  49.25 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  44.59 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.75 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  41.67 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>