212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0088 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  58.42 
 
 
307 aa  308  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  56.12 
 
 
311 aa  303  2e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  54.72 
 
 
302 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  52.92 
 
 
308 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  52.1 
 
 
318 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  52.1 
 
 
318 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  52.1 
 
 
318 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  52.6 
 
 
308 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  48.06 
 
 
319 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  53 
 
 
311 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  53.23 
 
 
308 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  50.32 
 
 
317 aa  274  1e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  52.75 
 
 
320 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  46.75 
 
 
306 aa  270  3e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  51.44 
 
 
329 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  51.72 
 
 
317 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  46.38 
 
 
316 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  48.05 
 
 
309 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  49.84 
 
 
317 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  49.03 
 
 
305 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  48.52 
 
 
306 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  48.52 
 
 
306 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  45.45 
 
 
308 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  46.56 
 
 
306 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  46.1 
 
 
309 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  41.01 
 
 
305 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  41.01 
 
 
305 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
305 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  39.93 
 
 
305 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  38.69 
 
 
306 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  41.45 
 
 
305 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  40.36 
 
 
305 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  39.43 
 
 
305 aa  200  2e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  40.39 
 
 
307 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  40.45 
 
 
310 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  40.07 
 
 
290 aa  184  1e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  37.79 
 
 
306 aa  174  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  40.83 
 
 
279 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  37.21 
 
 
307 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  37.42 
 
 
307 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  39.79 
 
 
279 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  39.72 
 
 
331 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  34.19 
 
 
333 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  35.48 
 
 
306 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  32.6 
 
 
333 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  32.6 
 
 
333 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  36.18 
 
 
295 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  38.87 
 
 
278 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  36.24 
 
 
290 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  28.25 
 
 
318 aa  137  3e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  37.28 
 
 
277 aa  135  7e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  38.3 
 
 
279 aa  132  7e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  37.68 
 
 
360 aa  130  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  31.37 
 
 
319 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  35.54 
 
 
286 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  30.63 
 
 
306 aa  114  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.41 
 
 
321 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  32.37 
 
 
323 aa  110  4e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  27.09 
 
 
271 aa  109  7e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.9 
 
 
1001 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.12 
 
 
1001 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  30.41 
 
 
975 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.23 
 
 
1003 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.98 
 
 
991 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.89 
 
 
993 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.02 
 
 
991 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.02 
 
 
991 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.4 
 
 
1004 aa  85.5  1e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.93 
 
 
1004 aa  84.3  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.33 
 
 
1003 aa  84.3  3e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  29.12 
 
 
1028 aa  82.8  7e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.89 
 
 
1221 aa  82.4  8e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.96 
 
 
1013 aa  81.3  2e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
1002 aa  80.9  3e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0300  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.34 
 
 
1264 aa  80.5  4e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.01 
 
 
1006 aa  79.7  6e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.16 
 
 
1085 aa  79.3  7e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1543  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.51 
 
 
1276 aa  79  9e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.386484  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03716  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.01 
 
 
1265 aa  78.6  1e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.933715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.64 
 
 
1004 aa  77.8  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4410  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.6 
 
 
1275 aa  76.6  5e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04017  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.06 
 
 
1049 aa  75.1  1e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.56 
 
 
990 aa  74.7  2e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0049  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.02 
 
 
1309 aa  74.7  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3018  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.71 
 
 
1320 aa  73.6  4e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.15 
 
 
1204 aa  73.6  4e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0656  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.87 
 
 
1236 aa  73.6  4e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  25.71 
 
 
996 aa  73.2  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2942  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.02 
 
 
1310 aa  73.2  6e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.47 
 
 
993 aa  73.2  6e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0113  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.02 
 
 
1310 aa  73.2  6e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0128  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.02 
 
 
1310 aa  73.2  6e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3887  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.39 
 
 
1309 aa  71.6  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>