224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0646 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  60.33 
 
 
308 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  63.45 
 
 
307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  59.09 
 
 
308 aa  349  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  54.28 
 
 
316 aa  331  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  54.52 
 
 
319 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  55.34 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  53.44 
 
 
302 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  53.57 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  51.96 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  53.4 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  50.48 
 
 
317 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  52.87 
 
 
317 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  50 
 
 
306 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  52.77 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  50.97 
 
 
305 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  52.61 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  53.23 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  49.36 
 
 
329 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  49.68 
 
 
320 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  48.86 
 
 
317 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  48.21 
 
 
308 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  47.73 
 
 
309 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  42.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  42.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  42.81 
 
 
305 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  42.45 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  42.09 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  39.41 
 
 
306 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  43.37 
 
 
307 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  39.21 
 
 
305 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  38.49 
 
 
305 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  41.49 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  41.4 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  40.14 
 
 
331 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  40.65 
 
 
286 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  39.08 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  37.29 
 
 
307 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  34.69 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  35.76 
 
 
306 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  34.28 
 
 
333 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  34.28 
 
 
333 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  36.11 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  36.27 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  35.69 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  35 
 
 
295 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  36.33 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  35.56 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  28.31 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  35.23 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  31.99 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  37.01 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  33.69 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  31.23 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.93 
 
 
1001 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  30.22 
 
 
321 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.19 
 
 
1003 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  27.49 
 
 
271 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.95 
 
 
991 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.46 
 
 
1001 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29 
 
 
1013 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.69 
 
 
1004 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 
996 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.12 
 
 
1004 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.7 
 
 
990 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.64 
 
 
1003 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.32 
 
 
993 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.36 
 
 
993 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1006 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.05 
 
 
1055 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.13 
 
 
1002 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.2 
 
 
1040 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.56 
 
 
1004 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3321  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.24 
 
 
1249 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170675  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27 
 
 
1221 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1661  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.41 
 
 
1050 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0656  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.51 
 
 
1236 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2702  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.53 
 
 
1050 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.4 
 
 
991 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.4 
 
 
991 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1655  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.11 
 
 
1050 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.01 
 
 
1080 aa  72.4  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.907532  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1768  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.93 
 
 
1002 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3765  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.68 
 
 
1318 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.87 
 
 
1052 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1138  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.04 
 
 
1085 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  26.4 
 
 
1191 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1695  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.13 
 
 
1135 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131291  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.81 
 
 
1043 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  29.81 
 
 
1028 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>