233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0662 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  666    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  46.75 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  43.46 
 
 
305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  41.83 
 
 
305 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  42.16 
 
 
305 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  41.83 
 
 
305 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  41.83 
 
 
305 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  41.83 
 
 
305 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  42.16 
 
 
305 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  41.83 
 
 
305 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  42.16 
 
 
305 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  41.5 
 
 
305 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  42.16 
 
 
305 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  41.83 
 
 
305 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  41.18 
 
 
305 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  45.36 
 
 
307 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  45.42 
 
 
307 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  39.33 
 
 
306 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  43.18 
 
 
302 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  44.88 
 
 
311 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  44.48 
 
 
306 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  41.58 
 
 
310 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  42.6 
 
 
308 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  35.08 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  42.4 
 
 
308 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  41.45 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  40.56 
 
 
316 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  40.59 
 
 
308 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  42.46 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  37.94 
 
 
318 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  37.94 
 
 
318 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  37.94 
 
 
318 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  37 
 
 
319 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  41.64 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  42.5 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  33.01 
 
 
333 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  41.94 
 
 
307 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  37.72 
 
 
290 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  34.09 
 
 
333 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  34.09 
 
 
333 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  40.91 
 
 
305 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  42.81 
 
 
311 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  39.49 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  38.1 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  40.14 
 
 
308 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  37.82 
 
 
309 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  30.58 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  37.38 
 
 
329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  39.72 
 
 
308 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  37.32 
 
 
278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  35.58 
 
 
320 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  37.07 
 
 
290 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  35.84 
 
 
306 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  35.25 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  34.81 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  32.9 
 
 
319 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  35.38 
 
 
277 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  33.45 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  37.59 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  33.57 
 
 
323 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  32.52 
 
 
321 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  28.29 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  32.01 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  32.74 
 
 
286 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
996 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1001 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
991 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.24 
 
 
1004 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.63 
 
 
1004 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1006 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.69 
 
 
1003 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.4 
 
 
993 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.85 
 
 
993 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.98 
 
 
1059 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28 
 
 
990 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.71 
 
 
1064 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000319641  normal  0.250381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0880  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.86 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3122  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.43 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204453  normal  0.110597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0850  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.43 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.282209  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0904  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.86 
 
 
1059 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197285  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3458  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.86 
 
 
1064 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00916432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0913  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.86 
 
 
1064 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00674805  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3774  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.14 
 
 
1059 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  30.59 
 
 
1028 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.63 
 
 
1001 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0568  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.03 
 
 
1064 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.64 
 
 
991 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.64 
 
 
991 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3099  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.43 
 
 
1064 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0987306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.23 
 
 
1323 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0722  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.53 
 
 
1227 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.23 
 
 
1323 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.23 
 
 
1323 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  26.93 
 
 
1191 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4442  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.06 
 
 
1310 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0615  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.42 
 
 
1059 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.381714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.88 
 
 
1002 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3765  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.25 
 
 
1318 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2676  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.77 
 
 
1058 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0314551  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>