235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0480 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  100 
 
 		 316 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  65.32 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  61.98 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  59.18 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  60.06 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  60.9 
 
 		 306 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  55.73 
 
 		 306 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  57.19 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  53.33 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  53.33 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  53.33 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  57.83 
 
 		 305 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  58.15 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  56.15 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  53.77 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  51.1 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  52.26 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  53.33 
 
 		 308 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  53.48 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  53.8 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  51.89 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  53.35 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  53.99 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  51.12 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  51.8 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  46.01 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  38.54 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  38.54 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  38.54 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  38.54 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  38.54 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  38.61 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  38.61 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  38.61 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  38.61 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  38.85 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  37.58 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  37.58 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  37.94 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  42.95 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.44 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  41.9 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  38.49 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  37.14 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  40.38 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  40.56 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  36.66 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  37.81 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  32.08 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  39.15 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  31.55 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  31.55 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  35.42 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  34.53 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  35.89 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  35.33 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  32.64 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  32.71 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  28.72 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  32.13 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  31.94 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  32.29 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  32.86 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  33.1 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  32.62 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  28.4 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.93 
 
 		 993 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.7 
 
 		 990 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.27 
 
 		 993 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.75 
 
 		 1013 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.34 
 
 		 991 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.34 
 
 		 991 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.62 
 
 		 996 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.47 
 
 		 991 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.88 
 
 		 1001 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.52 
 
 		 1003 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.09 
 
 		 1001 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.62 
 
 		 1003 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.05 
 
 		 1006 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.86 
 
 		 1004 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.93 
 
 		 1004 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.23 
 
 		 1004 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  29.25 
 
 		 975 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  29.25 
 
 		 1028 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.62 
 
 		 1002 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.45 
 
 		 1040 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  28.01 
 
 		 1191 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.01 
 
 		 1240 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03716  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.44 
 
 		 1265 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.933715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0149  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.8 
 
 		 1325 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1541  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 		 1320 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1323 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1323 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1323 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2931  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.62 
 
 		 1323 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.637197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2811  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 		 1361 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3321  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.01 
 
 		 1249 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170675  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.3 
 
 		 1055 aa  70.1  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0570  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 		 1241 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2628  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.75 
 
 		 1320 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>