210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1324 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  69.97 
 
 
333 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  69.97 
 
 
333 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  46.51 
 
 
305 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  46.33 
 
 
305 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  45.21 
 
 
305 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  43.56 
 
 
305 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  43.93 
 
 
305 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  43.56 
 
 
305 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  43.56 
 
 
305 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  43.56 
 
 
305 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  43.23 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  43.23 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  43.23 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  43.23 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  43.23 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  39.34 
 
 
307 aa  228  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  35.5 
 
 
306 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  36.03 
 
 
306 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  32.99 
 
 
307 aa  185  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  30.67 
 
 
302 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  34.35 
 
 
307 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  33.12 
 
 
310 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  33.01 
 
 
331 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  34.75 
 
 
290 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  33.95 
 
 
311 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  35.07 
 
 
305 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  35.16 
 
 
306 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  33.45 
 
 
308 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  34.56 
 
 
311 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  34.44 
 
 
306 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  34.87 
 
 
319 aa  162  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  31.8 
 
 
318 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  31.8 
 
 
318 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  31.8 
 
 
318 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  33.21 
 
 
306 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  34.29 
 
 
308 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  31.09 
 
 
329 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  32.76 
 
 
317 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  32.29 
 
 
316 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  30.72 
 
 
320 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  35.56 
 
 
307 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  33.7 
 
 
308 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  29.08 
 
 
308 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  31.47 
 
 
317 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  31.37 
 
 
306 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  32.98 
 
 
317 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  31.77 
 
 
308 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  30.74 
 
 
309 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  29.41 
 
 
306 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  30.43 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  28.94 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  31.29 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  30.4 
 
 
277 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  30.4 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  28.04 
 
 
306 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  27.11 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  26.55 
 
 
295 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  29.88 
 
 
271 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  27.84 
 
 
290 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  28.01 
 
 
319 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  24.47 
 
 
321 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  25.64 
 
 
279 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  25.91 
 
 
323 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.81 
 
 
993 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.36 
 
 
990 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  23.16 
 
 
286 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.37 
 
 
991 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.41 
 
 
993 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.3 
 
 
1001 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.71 
 
 
991 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.41 
 
 
991 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.36 
 
 
1004 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  24.07 
 
 
996 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1695  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.66 
 
 
1135 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131291  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.71 
 
 
1004 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2049  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.16 
 
 
1209 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.380237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25 
 
 
1004 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.13 
 
 
1204 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.85 
 
 
1001 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.93 
 
 
1063 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.27 
 
 
1221 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3946  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.88 
 
 
1003 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  25.67 
 
 
975 aa  69.7  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24 
 
 
1003 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.27 
 
 
1046 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.63 
 
 
1003 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.23 
 
 
1040 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.22 
 
 
1006 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.87 
 
 
1013 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  25.79 
 
 
1028 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2811  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.49 
 
 
1361 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0943  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.32 
 
 
1139 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613839  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.78 
 
 
1080 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.907532  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  24.76 
 
 
1191 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0667  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.61 
 
 
1044 aa  62.8  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.69 
 
 
1002 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.77 
 
 
1323 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.77 
 
 
1323 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.77 
 
 
1323 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>