97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2929 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  100 
 
 
278 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  72.54 
 
 
295 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  59.5 
 
 
279 aa  346  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  60.34 
 
 
290 aa  343  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  58.7 
 
 
277 aa  330  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  56.27 
 
 
279 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  57.4 
 
 
279 aa  295  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
306 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  37.91 
 
 
307 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  34.66 
 
 
305 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  38.63 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  33.94 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  33.94 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  33.57 
 
 
305 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  33.94 
 
 
305 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  33.21 
 
 
305 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  33.94 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  38.49 
 
 
307 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  37.32 
 
 
306 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  37.32 
 
 
331 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  41.34 
 
 
311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  35.71 
 
 
306 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  36.79 
 
 
310 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  38.73 
 
 
308 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  39.72 
 
 
308 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  36.46 
 
 
329 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  38.35 
 
 
307 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  36.27 
 
 
308 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  37.37 
 
 
317 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  35.56 
 
 
290 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  38.63 
 
 
302 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  38.87 
 
 
308 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  35.76 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  39.58 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  36.52 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  32.35 
 
 
306 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  35.07 
 
 
318 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  35.07 
 
 
318 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  35.07 
 
 
318 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  36.07 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  38.08 
 
 
306 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  37.63 
 
 
306 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  34.39 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  35.56 
 
 
308 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  36.56 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  31.94 
 
 
316 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  33.81 
 
 
317 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  30.4 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  37.04 
 
 
309 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  29.2 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  29.2 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  32.1 
 
 
306 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  25.37 
 
 
318 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  27.34 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  35.54 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  26.72 
 
 
271 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  29.41 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  27.94 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3164  Proline dehydrogenase  33.54 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 
996 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  29.41 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.53 
 
 
993 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.75 
 
 
1001 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.7 
 
 
1001 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.39 
 
 
990 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.08 
 
 
991 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.77 
 
 
1003 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.91 
 
 
993 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.26 
 
 
975 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.07 
 
 
991 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.66 
 
 
991 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0663  proline dehydrogenase  30.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.364988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.23 
 
 
1006 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.38 
 
 
1004 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.45 
 
 
1003 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.08 
 
 
1004 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13950  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.88 
 
 
1054 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0363  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.18 
 
 
1165 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1241  proline/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  21.72 
 
 
1166 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.97 
 
 
1046 aa  47  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54170  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.71 
 
 
1060 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.58 
 
 
1013 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.83 
 
 
1055 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4737  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.39 
 
 
1060 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  21.67 
 
 
1002 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.41 
 
 
1085 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4229  Aldehyde Dehydrogenase  26.46 
 
 
1144 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1044  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.36 
 
 
1030 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1541  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.05 
 
 
1320 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.174773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2773  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.75 
 
 
1031 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.848721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0398  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.16 
 
 
1041 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>