245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1500 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  42.37 
 
 
306 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  35.14 
 
 
305 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  35.51 
 
 
305 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  34.78 
 
 
305 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  34.78 
 
 
305 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  34.78 
 
 
305 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  37.1 
 
 
307 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  34.78 
 
 
305 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  34.42 
 
 
305 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  34.42 
 
 
305 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  34.42 
 
 
305 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  34.42 
 
 
305 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  34.42 
 
 
305 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  34.42 
 
 
305 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  33.33 
 
 
305 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  38.87 
 
 
307 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  33.69 
 
 
306 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  37.21 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  35.37 
 
 
290 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  36.5 
 
 
306 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  32.39 
 
 
306 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  33.69 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  36.59 
 
 
305 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  35.84 
 
 
331 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  37.68 
 
 
311 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  33.68 
 
 
310 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  37.96 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  34.86 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  33.55 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  36.1 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  33.66 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  34.72 
 
 
306 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  34.52 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  34.72 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  30.69 
 
 
318 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  30.69 
 
 
318 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  30.69 
 
 
318 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  35.19 
 
 
317 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  32.29 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  33.22 
 
 
319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  31.62 
 
 
317 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  33.22 
 
 
309 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  30.24 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  27.72 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  31.93 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  32.76 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  31.72 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  28.04 
 
 
333 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  28.62 
 
 
333 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  28.62 
 
 
333 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  30.63 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  32.1 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  29.52 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.37 
 
 
1001 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  27.52 
 
 
271 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.93 
 
 
1003 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  29.71 
 
 
323 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.06 
 
 
1001 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  30.18 
 
 
277 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  29.14 
 
 
295 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  28.67 
 
 
279 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  29.09 
 
 
321 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  28.52 
 
 
279 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.4 
 
 
1006 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  33.8 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  29.24 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.19 
 
 
1003 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  29.9 
 
 
975 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.49 
 
 
1013 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.85 
 
 
1004 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  27.82 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.11 
 
 
993 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.16 
 
 
1004 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.03 
 
 
1004 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
996 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.84 
 
 
991 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.84 
 
 
991 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1002 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.11 
 
 
991 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.79 
 
 
1055 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.71 
 
 
990 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  28.28 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
1028 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4410  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.11 
 
 
1275 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.52 
 
 
993 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1543  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.91 
 
 
1276 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.386484  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  28.29 
 
 
1191 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2676  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.61 
 
 
1058 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0314551  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0300  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.85 
 
 
1264 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.39 
 
 
1204 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.29 
 
 
1240 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.71 
 
 
1221 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4858  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.69 
 
 
1235 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019715  normal  0.487225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3321  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.36 
 
 
1249 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170675  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03716  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.7 
 
 
1265 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.933715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.92 
 
 
1040 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2202  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.7 
 
 
1028 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133189  normal  0.673915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0395  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1030 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  0.629543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0364  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.85 
 
 
1035 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>