237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0434 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  100 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  66.88 
 
 		 308 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  65.31 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  61.02 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  62.46 
 
 		 306 aa  346  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  55.95 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  60.26 
 
 		 309 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  60.66 
 
 		 302 aa  342  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  56.44 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  60.65 
 
 		 329 aa  338  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  57.65 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  57.65 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  57.7 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  57.65 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  62.54 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  60.66 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  58.03 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  58.77 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  56.68 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  57.47 
 
 		 306 aa  315  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  57 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  56.35 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  56.07 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  53.44 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  51.75 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  54.43 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  41.97 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  36.72 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  36.72 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  36.72 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  36.72 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  36.72 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  36.72 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  36.39 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  36.39 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  36.39 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  35.74 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.74 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  36.93 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  38.85 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  37.25 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  41.75 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  42.61 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  43.66 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  44.88 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  38.11 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  41.42 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  43.15 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  34.56 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  42.24 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  40.73 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  39.93 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  32.13 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  32.13 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  39.3 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  39.72 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  39.32 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  34.8 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  36.91 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  27.74 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  39.58 
 
 		 278 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  37.87 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  38.21 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.39 
 
 		 993 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  35.12 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.09 
 
 		 991 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.63 
 
 		 1001 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 		 1003 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.75 
 
 		 996 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 		 1004 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.83 
 
 		 1002 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  32.97 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.41 
 
 		 1001 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  25.09 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.64 
 
 		 990 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.79 
 
 		 993 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.03 
 
 		 1006 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.56 
 
 		 1013 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.7 
 
 		 1004 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 		 1004 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  31.29 
 
 		 975 aa  102  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.27 
 
 		 1003 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.33 
 
 		 991 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.33 
 
 		 991 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  32.54 
 
 		 1028 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  30.77 
 
 		 1191 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.45 
 
 		 1240 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04017  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.27 
 
 		 1049 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2812  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.19 
 
 		 1032 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3055  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.95 
 
 		 1001 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.554963  normal  0.0720353 
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.81 
 
 		 1046 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.1 
 
 		 1221 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3164  Proline dehydrogenase  34.13 
 
 		 446 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13950  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.62 
 
 		 1054 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0300  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.49 
 
 		 1264 aa  79.3  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4410  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.94 
 
 		 1275 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.61 
 
 		 1055 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.46 
 
 		 1085 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.71 
 
 		 1059 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5941  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.21 
 
 		 1345 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>