172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  100 
 
 
319 aa  662    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  60.13 
 
 
316 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  63.32 
 
 
307 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  59.49 
 
 
308 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  57.77 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  54.52 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  55.74 
 
 
308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  52.52 
 
 
317 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  52.24 
 
 
318 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  52.24 
 
 
318 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  52.24 
 
 
318 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  52.9 
 
 
306 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  53 
 
 
317 aa  319  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  54.02 
 
 
306 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  53.72 
 
 
306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  52.3 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  51.25 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  52.58 
 
 
305 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  54.52 
 
 
308 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  50 
 
 
317 aa  300  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  48.86 
 
 
302 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  48.72 
 
 
329 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  48.39 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  49.83 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  46.38 
 
 
306 aa  261  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  49.34 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  38.91 
 
 
305 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  38.91 
 
 
305 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
305 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  38.59 
 
 
305 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  37.94 
 
 
306 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  39.23 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  37.62 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  38.22 
 
 
305 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  37.18 
 
 
306 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  40.06 
 
 
307 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  41.02 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  38.26 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  37 
 
 
331 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  36.84 
 
 
307 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  38.57 
 
 
286 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  34.98 
 
 
306 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  34.3 
 
 
307 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  34.87 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  32.04 
 
 
333 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  32.04 
 
 
333 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  37.32 
 
 
360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  33.68 
 
 
279 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  33.33 
 
 
279 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  34.51 
 
 
277 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  34.39 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  28.89 
 
 
318 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  33.22 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  32.45 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.64 
 
 
321 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  31.68 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  31.8 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  31.74 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  34.15 
 
 
279 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.05 
 
 
993 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.72 
 
 
991 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  27.67 
 
 
271 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.12 
 
 
993 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.99 
 
 
990 aa  99.4  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  27.61 
 
 
996 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
991 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
991 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  28.77 
 
 
1028 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 
1055 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 
1013 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.1 
 
 
1001 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.97 
 
 
1003 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.02 
 
 
1006 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.08 
 
 
1004 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.71 
 
 
1003 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  29.25 
 
 
975 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.86 
 
 
1001 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.39 
 
 
1221 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.02 
 
 
1004 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.22 
 
 
1002 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0395  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.53 
 
 
1030 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  0.629543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.09 
 
 
1004 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.86 
 
 
1040 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03716  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.62 
 
 
1265 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.933715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1543  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.39 
 
 
1276 aa  72.4  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.386484  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.06 
 
 
1204 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2218  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.92 
 
 
1268 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.19 
 
 
1085 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1695  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.21 
 
 
1135 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131291  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5941  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.38 
 
 
1345 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0398  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.45 
 
 
1041 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  27.6 
 
 
1191 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0641  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.96 
 
 
1046 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.546222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0744  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.96 
 
 
1046 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>