263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4838 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  100 
 
 
305 aa  625  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  96.72 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  96.72 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  96.72 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  96.72 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  96.72 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  96.72 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  96.72 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  96.72 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  96.07 
 
 
305 aa  608  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  91.15 
 
 
305 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  79.34 
 
 
305 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  78.03 
 
 
305 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  52.94 
 
 
307 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  44.55 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  41.18 
 
 
331 aa  261  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  42.07 
 
 
310 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  43.56 
 
 
333 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  43.56 
 
 
333 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  41.91 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  43.93 
 
 
333 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  42.62 
 
 
306 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  40 
 
 
307 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  38.82 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  41.64 
 
 
290 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  38.31 
 
 
308 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  40.92 
 
 
306 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  41.58 
 
 
308 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  42.18 
 
 
307 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  38.82 
 
 
316 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  38.59 
 
 
319 aa  222  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  37.9 
 
 
317 aa  221  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
318 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
318 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
318 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  38.18 
 
 
311 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  39.27 
 
 
305 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  36.84 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  36.71 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  42.81 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  39.27 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  37.55 
 
 
311 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  39.93 
 
 
308 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  36.2 
 
 
306 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  35.03 
 
 
320 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  34.62 
 
 
329 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  34.77 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  37.38 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  35.81 
 
 
309 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  34.09 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  35.42 
 
 
290 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  35.38 
 
 
279 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  35.74 
 
 
279 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  34.42 
 
 
306 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  33.45 
 
 
295 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  33.57 
 
 
278 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  34.3 
 
 
277 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  31.75 
 
 
318 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  34.91 
 
 
279 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  33.09 
 
 
309 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  30.26 
 
 
321 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.33 
 
 
993 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.23 
 
 
991 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  26.88 
 
 
319 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  31.05 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.71 
 
 
993 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  28.77 
 
 
323 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.84 
 
 
991 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.84 
 
 
991 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.78 
 
 
990 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  29.32 
 
 
996 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.06 
 
 
1001 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
1003 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  26.6 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.94 
 
 
1004 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.56 
 
 
1004 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.93 
 
 
1004 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.16 
 
 
1001 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.83 
 
 
1013 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 
1006 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.36 
 
 
1003 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
1028 aa  99  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1002 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  27.01 
 
 
975 aa  95.9  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.63 
 
 
1221 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.18 
 
 
1052 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.43 
 
 
1043 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3946  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.5 
 
 
1003 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1768  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.47 
 
 
1002 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0169  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1039 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0936263  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.14 
 
 
1043 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  26.6 
 
 
1191 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.38 
 
 
1323 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.38 
 
 
1323 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.38 
 
 
1323 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.6 
 
 
1240 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54170  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.27 
 
 
1060 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.71 
 
 
1204 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4737  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.98 
 
 
1060 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.14 
 
 
1040 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>