134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4054 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  100 
 
 
279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  61.82 
 
 
295 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  61.03 
 
 
290 aa  363  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  59.5 
 
 
278 aa  346  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  58.48 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  58.06 
 
 
279 aa  338  5e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  60.79 
 
 
279 aa  329  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  38.27 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  35.74 
 
 
305 aa  178  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  35.74 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  35.74 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  35.74 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  35.74 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  34.66 
 
 
305 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  35.38 
 
 
305 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  35.38 
 
 
305 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  35.38 
 
 
305 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  35.38 
 
 
305 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  35.38 
 
 
305 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  34.3 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  38.13 
 
 
307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  38.93 
 
 
308 aa  171  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  40.83 
 
 
308 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  34.74 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  39.5 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  34.3 
 
 
305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  39.86 
 
 
311 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  36.79 
 
 
310 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  38.16 
 
 
308 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  39.78 
 
 
307 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  39.79 
 
 
306 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  35.14 
 
 
307 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  39.3 
 
 
311 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  36.46 
 
 
329 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  37.02 
 
 
317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  39.43 
 
 
306 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  32.85 
 
 
306 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
318 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
318 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  35.99 
 
 
318 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  37.28 
 
 
302 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  34.72 
 
 
320 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  35.69 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  36.18 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  35.42 
 
 
306 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  35.97 
 
 
306 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  35.59 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  32.64 
 
 
316 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  35.25 
 
 
331 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  33.68 
 
 
319 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  36.27 
 
 
309 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  29.75 
 
 
318 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  35.69 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  35.44 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  28.94 
 
 
333 aa  129  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  28.26 
 
 
333 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  28.26 
 
 
333 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  31.03 
 
 
319 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  37.81 
 
 
309 aa  118  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  29.49 
 
 
271 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  29.52 
 
 
306 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  30.94 
 
 
323 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  30.88 
 
 
286 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  28.04 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.75 
 
 
996 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.42 
 
 
1003 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.13 
 
 
1001 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.41 
 
 
1004 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.48 
 
 
1004 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  27.48 
 
 
975 aa  75.5  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.87 
 
 
1001 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.62 
 
 
1003 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.91 
 
 
993 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.56 
 
 
1006 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.2 
 
 
1013 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04017  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.71 
 
 
1049 aa  63.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.84 
 
 
1004 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54170  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.42 
 
 
1060 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.58 
 
 
1002 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4737  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.1 
 
 
1060 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.27 
 
 
1046 aa  55.8  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3164  Proline dehydrogenase  27.91 
 
 
446 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.96 
 
 
990 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.69 
 
 
991 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.69 
 
 
991 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.08 
 
 
991 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  24.49 
 
 
1028 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.27 
 
 
1085 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  21.6 
 
 
993 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0663  proline dehydrogenase  23.57 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.364988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.76 
 
 
1040 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.6 
 
 
1221 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1241  proline/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23 
 
 
1166 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0641  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.79 
 
 
1046 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.546222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4810  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.16 
 
 
992 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0744  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.79 
 
 
1046 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13950  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.95 
 
 
1054 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4229  Aldehyde Dehydrogenase  26.24 
 
 
1144 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0398  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.71 
 
 
1041 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>