256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0599 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  49.18 
 
 
306 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  47.4 
 
 
307 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  45.54 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  45.54 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  45.54 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  45.54 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  45.21 
 
 
305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  45.21 
 
 
305 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  45.21 
 
 
305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  45.87 
 
 
305 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  44.55 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  46.18 
 
 
307 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  43.56 
 
 
305 aa  262  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  42.81 
 
 
317 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  44.96 
 
 
307 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  42.96 
 
 
306 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  43.38 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  42.05 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  44.13 
 
 
290 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  40.92 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  41.78 
 
 
311 aa  238  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  42.07 
 
 
311 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  41.5 
 
 
308 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  42.67 
 
 
310 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  40.52 
 
 
306 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  41.39 
 
 
308 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  40.59 
 
 
305 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  39.87 
 
 
306 aa  228  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  40.39 
 
 
318 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  40.39 
 
 
318 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  40.39 
 
 
318 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  42.07 
 
 
307 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  41.1 
 
 
329 aa  219  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  38.76 
 
 
309 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  38.83 
 
 
333 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  37.94 
 
 
319 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  38.83 
 
 
333 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  37.9 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  37.42 
 
 
316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  37.7 
 
 
308 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  39.33 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  37.1 
 
 
317 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  39.41 
 
 
308 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  38.51 
 
 
320 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  38.69 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  35.5 
 
 
333 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  33.79 
 
 
318 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
278 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  37.68 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  37.68 
 
 
277 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  37.7 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  33.69 
 
 
306 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  36.08 
 
 
290 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  36.23 
 
 
279 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  34.34 
 
 
271 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  34.13 
 
 
295 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  30.66 
 
 
319 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  31.99 
 
 
323 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  32.98 
 
 
321 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.27 
 
 
993 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.79 
 
 
991 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.26 
 
 
993 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.18 
 
 
990 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.79 
 
 
991 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.79 
 
 
991 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  27.5 
 
 
286 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  27.74 
 
 
996 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  28.83 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.88 
 
 
975 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  28.08 
 
 
1191 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.38 
 
 
1001 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.61 
 
 
1003 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.08 
 
 
1240 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.84 
 
 
1003 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.08 
 
 
1013 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.71 
 
 
1001 aa  92.4  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.79 
 
 
1006 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  26.69 
 
 
1028 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2676  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.17 
 
 
1058 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0314551  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3321  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.93 
 
 
1249 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170675  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.36 
 
 
1052 aa  85.5  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.53 
 
 
1059 aa  85.9  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0689  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.1 
 
 
1064 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.04 
 
 
1040 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3099  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.02 
 
 
1064 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0987306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0615  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.65 
 
 
1059 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.381714  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.67 
 
 
1004 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3774  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.71 
 
 
1059 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.91 
 
 
1004 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0850  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.95 
 
 
1064 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.282209  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3122  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.95 
 
 
1064 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204453  normal  0.110597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.36 
 
 
1004 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.95 
 
 
1064 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000319641  normal  0.250381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3490  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.88 
 
 
1064 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000664694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3846  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.9 
 
 
1064 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128071  hitchhiker  0.00000551465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>