64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2645 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 254 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  56.92 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  43.25 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  45.02 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  36.18 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  38.06 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.43 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  39.86 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 768 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.38 
 
 		 748 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  30.89 
 
 		 736 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  31.96 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  27.38 
 
 		 977 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  40.3 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  26.77 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  30.53 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.91 
 
 		 767 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  23.89 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.41 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  29.95 
 
 		 998 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.96 
 
 		 964 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  29.9 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  25.54 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  27.31 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  28.96 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  26.4 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  31.91 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.98 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  27.2 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  26 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  26.03 
 
 		 972 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  25.49 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  31.2 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  31.08 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  24.03 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.19 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  31.79 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.88 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  34.91 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  28.65 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  28.95 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 319 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  29.25 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>