More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2169 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  68.93 
 
 		 764 aa  1020    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  88.83 
 
 		 753 aa  1347    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  71.29 
 
 		 759 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  71.8 
 
 		 760 aa  1059    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 756 aa  1519    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  46.12 
 
 		 725 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  46.17 
 
 		 723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  46.17 
 
 		 723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  41.8 
 
 		 729 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  38.81 
 
 		 744 aa  459  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.86 
 
 		 754 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  36.43 
 
 		 729 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  36.25 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 721 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.41 
 
 		 670 aa  317  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.05 
 
 		 737 aa  313  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  31.22 
 
 		 753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 		 741 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.57 
 
 		 696 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 		 758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 		 734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.82 
 
 		 758 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 		 794 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.24 
 
 		 657 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 758 aa  260  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 		 746 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  28.89 
 
 		 758 aa  258  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.15 
 
 		 656 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 738 aa  247  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.78 
 
 		 658 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 		 701 aa  238  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.02 
 
 		 650 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.64 
 
 		 656 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.66 
 
 		 672 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 		 641 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 		 752 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 645 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.52 
 
 		 643 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.73 
 
 		 694 aa  197  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 696 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.73 
 
 		 936 aa  195  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.49 
 
 		 701 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 		 667 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.98 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.75 
 
 		 761 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  36.98 
 
 		 717 aa  174  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 		 735 aa  173  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  34.25 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.17 
 
 		 611 aa  170  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.27 
 
 		 652 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 638 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  31.17 
 
 		 499 aa  168  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 		 744 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 		 665 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.97 
 
 		 708 aa  160  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.43 
 
 		 757 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.02 
 
 		 597 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 		 675 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  35.56 
 
 		 636 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.46 
 
 		 483 aa  150  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 681 aa  150  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 702 aa  150  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.46 
 
 		 483 aa  150  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 284 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 		 699 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  40.74 
 
 		 724 aa  147  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 864 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 		 861 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 593 aa  142  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.32 
 
 		 441 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.57 
 
 		 703 aa  141  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 		 860 aa  140  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  25.31 
 
 		 582 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.58 
 
 		 701 aa  140  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.87 
 
 		 431 aa  140  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  34.58 
 
 		 701 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.75 
 
 		 713 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  30.43 
 
 		 671 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  26.82 
 
 		 635 aa  137  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 		 911 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 		 1207 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 		 859 aa  134  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 421 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.74 
 
 		 648 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 		 858 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 671 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.4 
 
 		 903 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 654 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.22 
 
 		 643 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.64 
 
 		 637 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.09 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 		 536 aa  124  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 		 643 aa  124  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  28.45 
 
 		 632 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 		 483 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>