166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0071 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  79.79 
 
 		 480 aa  730    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 504 aa  1004    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  69.25 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  66.59 
 
 		 476 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  64 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  63.71 
 
 		 485 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  64.06 
 
 		 476 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  43.07 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  40.15 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  36.97 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  35.02 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  36.19 
 
 		 442 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  36.8 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  35.96 
 
 		 442 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  33.98 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  34.47 
 
 		 422 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  35.52 
 
 		 419 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  35.11 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  36.1 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  34.25 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  36.49 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  31.92 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  33.66 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  32.62 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  34.58 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  31.73 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  32.35 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.07 
 
 		 479 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.17 
 
 		 436 aa  127  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  30.41 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  33.5 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.93 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  30.05 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  33.1 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  32.92 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  32.93 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  33.42 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.46 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.69 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.18 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.47 
 
 		 435 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  33.91 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  28.89 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  28.13 
 
 		 470 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.62 
 
 		 427 aa  96.7  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.53 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  27.42 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  27.57 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  28.31 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.05 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  26.44 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.17 
 
 		 1199 aa  71.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.02 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  27.62 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27.83 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  26.7 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.65 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  26.24 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.05 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  38.54 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  27.51 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  45.31 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  23.44 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  23.97 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  23.18 
 
 		 999 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  27.3 
 
 		 411 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08162  amine oxidase, flavin-containing superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G01210)  43.86 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  27.08 
 
 		 407 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  46.55 
 
 		 454 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  34.88 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  34.88 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.75 
 
 		 536 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  32.26 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  52.27 
 
 		 487 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  42.11 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  27.86 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  40.26 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  35.05 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  40.26 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  46.55 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  40.26 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  24.66 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  37.18 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  24.92 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  38.46 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  41.27 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  39.13 
 
 		 528 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  23.52 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  41.38 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  39.24 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  28.98 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  31.82 
 
 		 511 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  23.72 
 
 		 657 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  27.1 
 
 		 1274 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  42.86 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.08 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>