87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2514 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  75.56 
 
 		 530 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 540 aa  1084    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  61.06 
 
 		 537 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  60.41 
 
 		 538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  57.25 
 
 		 532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  55.6 
 
 		 527 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  51.25 
 
 		 595 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  55.76 
 
 		 532 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  51.07 
 
 		 568 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  54.07 
 
 		 531 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  53.02 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  48.05 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  46.73 
 
 		 619 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  41.6 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  45.67 
 
 		 621 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  27.73 
 
 		 660 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.28 
 
 		 679 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  25.92 
 
 		 679 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 676 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  25.29 
 
 		 692 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.26 
 
 		 675 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  25.82 
 
 		 696 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  25.67 
 
 		 696 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  27.9 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  24.11 
 
 		 669 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28 
 
 		 584 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.64 
 
 		 584 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  25.26 
 
 		 691 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.22 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  27.36 
 
 		 599 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  29.76 
 
 		 585 aa  96.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  26.61 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  22.82 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  22.59 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  26.86 
 
 		 601 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  24.44 
 
 		 600 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  29.61 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  22.72 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  32.31 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  26.56 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  30.87 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  34.35 
 
 		 748 aa  57  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.98 
 
 		 606 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  31.37 
 
 		 595 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  27.69 
 
 		 668 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  29.13 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 423 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.75 
 
 		 472 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.79 
 
 		 797 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.3 
 
 		 600 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  29.73 
 
 		 547 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  29.32 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  32.11 
 
 		 761 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.25 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  21.13 
 
 		 672 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.51 
 
 		 784 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  27.48 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.92 
 
 		 722 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1648  heterodisulfide reductase, subunit A  28.26 
 
 		 427 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0282926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  24.63 
 
 		 757 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 457 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  22.84 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.55 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  27.4 
 
 		 758 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  26.88 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  26.21 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.25 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0850  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.24 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  27.73 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  20.94 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27.78 
 
 		 764 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  26.76 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  55 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  55 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 660 aa  44.3  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 660 aa  44.3  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0125  NADPH:2,4-dienoyl-CoA reductase  50.94 
 
 		 672 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 557 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.26 
 
 		 993 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3199  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.5 
 
 		 413 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.524731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2458  2,4-dienoyl-CoA reductase  45.45 
 
 		 675 aa  43.5  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1884  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 419 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.254068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.35 
 
 		 725 aa  43.5  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>