More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1852 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 307 aa  594  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  64.92 
 
 		 307 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  65.25 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  48.47 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.86 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  42.57 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.62 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  46.28 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  45.72 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  43.75 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.06 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.95 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.05 
 
 		 304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  37.17 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  40.39 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  37.25 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  40.46 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  39.87 
 
 		 403 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.28 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  41.28 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  45.36 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02608  threonine dehydratase  40.92 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  31.1 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  41.16 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  42.63 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  39.54 
 
 		 403 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  39.09 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  34.92 
 
 		 408 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.75 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.18 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  35.06 
 
 		 402 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.28 
 
 		 509 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  39.54 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  32.45 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  38.66 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  32.2 
 
 		 437 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  40.78 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  38.11 
 
 		 414 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  40.78 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.54 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  33.12 
 
 		 403 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  39.23 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3331  threonine dehydratase  40.86 
 
 		 363 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  37.58 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.1 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  40.21 
 
 		 402 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  39.27 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.7 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  38.11 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  32.45 
 
 		 402 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0227  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.83 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.86 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 403 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  41.26 
 
 		 402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.86 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  40.14 
 
 		 402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  40.43 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  39.39 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  32.8 
 
 		 408 aa  144  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  33.12 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  37.13 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  32.13 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  33.44 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.02 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  35.79 
 
 		 517 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.12 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  34.39 
 
 		 517 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  32.52 
 
 		 418 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  37.99 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1110  threonine dehydratase  37.21 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.7 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1204  threonine dehydratase  37.21 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.45 
 
 		 511 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  33.77 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.7 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  31.37 
 
 		 403 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.94 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  33.87 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  34.19 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  36.31 
 
 		 426 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  34.19 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  34.19 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  35.92 
 
 		 415 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  37.46 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1447  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.42 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  34.19 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  36.31 
 
 		 426 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  34.19 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  36.31 
 
 		 426 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  33.67 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  34.19 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>