More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0909 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  100 
 
 		 398 aa  776    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  64.41 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  58.4 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  56.91 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  52.23 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  51.18 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  51.28 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  48.23 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  49.25 
 
 		 409 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  50.91 
 
 		 412 aa  338  9e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 399 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 399 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  50.26 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  53.71 
 
 		 422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  52.93 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  51.81 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  46.52 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  49.1 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  47.09 
 
 		 416 aa  315  9e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  48.49 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  47.88 
 
 		 421 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  46.77 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.02 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.37 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.52 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 403 aa  298  9e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  46.77 
 
 		 403 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  45.71 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  40.94 
 
 		 403 aa  285  8e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.35 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  36.82 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  36.41 
 
 		 402 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  42.64 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.33 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.44 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  38.92 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 403 aa  265  7e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  43.3 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  42.06 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  37.41 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  42.71 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  40.89 
 
 		 403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.55 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  39.64 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  39.65 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  42 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  36.29 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  40.8 
 
 		 403 aa  255  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  40.25 
 
 		 403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.53 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  41.84 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.29 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  43.99 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  40.6 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  40 
 
 		 421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 410 aa  245  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  40.46 
 
 		 416 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  38.6 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  41.79 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  34.69 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.97 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.28 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  36.25 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.45 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  42.13 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.67 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  36.29 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  38.27 
 
 		 537 aa  228  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  44.8 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  38.19 
 
 		 412 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  37.95 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  39.2 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  40 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  40.24 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  39.21 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  38.44 
 
 		 479 aa  222  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.46 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  36.72 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.71 
 
 		 501 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>