More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3496 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  77.74 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  63.99 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  61.61 
 
 		 302 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  61.68 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  61.64 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  52.72 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  50.47 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  46.43 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  49.34 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  45.96 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  46.31 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  48.99 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  46.51 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  37.14 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.61 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  46.71 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  41.35 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.85 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.66 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.76 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  30.16 
 
 		 403 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  34.1 
 
 		 514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  37.94 
 
 		 403 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.05 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  36.88 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  34.73 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  37.3 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  36.57 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.68 
 
 		 511 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  36.25 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  35.87 
 
 		 402 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  36.98 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 401 aa  155  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  37.81 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.35 
 
 		 511 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.01 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  36.19 
 
 		 403 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  29.02 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.34 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.54 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  30.16 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  30.74 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.76 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  35.78 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.31 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  31.11 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  32.8 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  36.97 
 
 		 514 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 511 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 509 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  39.13 
 
 		 479 aa  146  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  36.57 
 
 		 402 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  37.46 
 
 		 403 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  37.24 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  36.66 
 
 		 406 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  32.37 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  33.77 
 
 		 506 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  33.77 
 
 		 506 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  35.99 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.86 
 
 		 507 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.35 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.99 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  36.86 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  34.29 
 
 		 415 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  36.86 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  35.06 
 
 		 509 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  36.86 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  34.19 
 
 		 501 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  31.43 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  36.55 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  36.46 
 
 		 520 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  30.12 
 
 		 404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1506  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.03 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.15 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  29.84 
 
 		 403 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.94 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  30.39 
 
 		 437 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  32.75 
 
 		 501 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  31.74 
 
 		 537 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  30.1 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.5 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  29.1 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.51 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  33.98 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  36.51 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  36.24 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  39.51 
 
 		 545 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 402 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  38.91 
 
 		 407 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>