More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3336 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  86.82 
 
 		 313 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  72.03 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  68.59 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  50.86 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  50.17 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  47.26 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  46.47 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  46.69 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  44.79 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  46.86 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  42.03 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  42.26 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  43.54 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  35.23 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.9 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.02 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  35.9 
 
 		 403 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.07 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  34.2 
 
 		 509 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  36.9 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.35 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  31.16 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  36.9 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  35.83 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.46 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  32.55 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.27 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.11 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  39.27 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  33.45 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.05 
 
 		 402 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  30.69 
 
 		 402 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  32.97 
 
 		 511 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  30.39 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.11 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  27.63 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.79 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.25 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  32.49 
 
 		 526 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  28.29 
 
 		 403 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 504 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 504 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  34.16 
 
 		 406 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  35.13 
 
 		 402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  28.9 
 
 		 511 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  30.69 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  27.63 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.11 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  32.28 
 
 		 517 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  28.57 
 
 		 511 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  32.08 
 
 		 507 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.61 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.06 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  31.93 
 
 		 517 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  27.63 
 
 		 403 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.19 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  33.75 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  28.19 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  30.62 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  33.21 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  31.52 
 
 		 501 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  34.2 
 
 		 506 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  34.2 
 
 		 506 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.14 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.42 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  33.99 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  34.06 
 
 		 515 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  29.17 
 
 		 514 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0980  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.19 
 
 		 326 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  31.05 
 
 		 501 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.15 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.97 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.17 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  30.55 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  25.94 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  32.89 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  30.8 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1588  L-threonine ammonia-lyase  38.21 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.77 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  32.14 
 
 		 527 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  31.54 
 
 		 537 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  31.02 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3899  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.65 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492177  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  35.36 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  35.74 
 
 		 504 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  29.08 
 
 		 403 aa  123  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  33.7 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  31.63 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  31.27 
 
 		 505 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  30.59 
 
 		 401 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  28.62 
 
 		 424 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  33.21 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  30.36 
 
 		 549 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1447  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.58 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0170532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>