More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0952 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  100 
 
 		 313 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  86.82 
 
 		 314 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  73.38 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  72.03 
 
 		 320 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  48.64 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  50.17 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  49.15 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  45.61 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  46.06 
 
 		 310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  46.69 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  47.64 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  50.18 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  45.31 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  42.71 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  44.6 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  45.32 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.18 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.44 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.76 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  35.25 
 
 		 509 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.64 
 
 		 514 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  35.53 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.11 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.53 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  30.56 
 
 		 408 aa  142  8e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  36.16 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  36.16 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.78 
 
 		 511 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  31.29 
 
 		 509 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  33.9 
 
 		 504 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  33.9 
 
 		 504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  32.88 
 
 		 403 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.88 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  33.45 
 
 		 507 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  32.13 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.29 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  34.57 
 
 		 506 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  34.57 
 
 		 506 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  31.67 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  32.13 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.25 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  33.57 
 
 		 526 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  33.77 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 402 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.86 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  37.77 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  31.21 
 
 		 437 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  33.21 
 
 		 501 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  34.12 
 
 		 515 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  28.09 
 
 		 513 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  29.96 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  32.49 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  30.07 
 
 		 424 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  30.32 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  33.78 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  34.78 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3899  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.13 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492177  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  28.33 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.94 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  34.24 
 
 		 504 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  40.34 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  31.67 
 
 		 517 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  29.6 
 
 		 511 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  29.24 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  32.69 
 
 		 522 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.77 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  32.12 
 
 		 517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4223  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.45 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.249037 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  28.52 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  31.39 
 
 		 401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  32.08 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  32.19 
 
 		 527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  31.27 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.65 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  31.39 
 
 		 515 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  30.59 
 
 		 401 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  34.3 
 
 		 514 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  31.97 
 
 		 520 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  30.91 
 
 		 505 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  31.03 
 
 		 400 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  27.85 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  29.05 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  34.65 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  36.13 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  27.85 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02390  serine family amino acid catabolism-related protein, putative  35.06 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  30.82 
 
 		 549 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  32.61 
 
 		 529 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.16 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  35.36 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  29.97 
 
 		 513 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 402 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  30.66 
 
 		 507 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0994  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.97 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.430606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  31.53 
 
 		 506 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  32.88 
 
 		 517 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  31.68 
 
 		 531 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>