More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2922 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  100 
 
 		 313 aa  614  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  67.33 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  50.17 
 
 		 317 aa  234  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  53.08 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  49.5 
 
 		 313 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  48.7 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  49.03 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  47.26 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  47.85 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  45.61 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  49.02 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  48.99 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  45.4 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  38.96 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.49 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0994  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.430606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.32 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.13 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.72 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.23 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.14 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  40.06 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  44.48 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.71 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 408 aa  175  7e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2085  threonine dehydratase catabolic  42.26 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  37.38 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.44 
 
 		 415 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  36.65 
 
 		 501 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.09 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.66 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2406  serine/threonine dehydratase family protein  41.94 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3316  threonine dehydratase catabolic  41.94 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1494  threonine dehydratase catabolic  41.94 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2515  threonine dehydratase catabolic  41.94 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1263  threonine dehydratase catabolic  41.94 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.139617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1991  threonine dehydratase catabolic  41.94 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.811048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1872  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.87 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0095677  normal  0.0115658 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2364  serine/threonine dehydratase family protein  41.61 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2315  putative amino-acid dehydratase  41.29 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314922  normal  0.569299 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  37.25 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  42.54 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.95 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 		 323 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  32.24 
 
 		 402 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  40 
 
 		 506 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  40 
 
 		 506 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  31.8 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  38.24 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  32.89 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 408 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  41.88 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  39.46 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.48 
 
 		 411 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.25 
 
 		 411 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  34.08 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  31.83 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  38.64 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.69 
 
 		 509 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.45 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.1 
 
 		 504 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  32.37 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1588  L-threonine ammonia-lyase  39.27 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  37.77 
 
 		 531 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  38.51 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.1 
 
 		 504 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  29.97 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.35 
 
 		 520 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  36.9 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.09 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  40.13 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  33.74 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.3 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  36.96 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.94 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  30.43 
 
 		 513 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  37.67 
 
 		 414 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  35.71 
 
 		 401 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.63 
 
 		 522 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.41 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  37.58 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  39.04 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  34.41 
 
 		 511 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 400 aa  152  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  31.09 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  37.11 
 
 		 416 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  34.77 
 
 		 507 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  37.41 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  34.05 
 
 		 511 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>