More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2783 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  100 
 
 		 302 aa  587  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  65.03 
 
 		 313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  61.61 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  60.67 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  58.68 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  63.43 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  54.6 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  50 
 
 		 308 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  50 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  49.2 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  48.7 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  52.54 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  49.15 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  46.47 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  49.21 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  52.35 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.34 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  43.79 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  37.34 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.55 
 
 		 414 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.56 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.42 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  42.26 
 
 		 406 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  39.16 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.7 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  40.5 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  38.27 
 
 		 507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  32.36 
 
 		 403 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  38.18 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  34.66 
 
 		 511 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.51 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  33.98 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.44 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.36 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  34.3 
 
 		 511 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  35.71 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  34.78 
 
 		 514 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  31.72 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  30.84 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  39.86 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  35.08 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  38.93 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  37.19 
 
 		 517 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 517 aa  155  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.75 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 509 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  35.38 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.99 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  38.55 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  36.23 
 
 		 501 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  37.01 
 
 		 403 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  37.7 
 
 		 503 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  31.49 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.44 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  30.84 
 
 		 403 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 527 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.44 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  34.16 
 
 		 549 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  35.76 
 
 		 506 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  35.76 
 
 		 506 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.27 
 
 		 514 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  36.92 
 
 		 529 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 537 aa  148  9e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  31.77 
 
 		 513 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 526 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  35.87 
 
 		 504 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  37.14 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  34.31 
 
 		 501 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.55 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.64 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.87 
 
 		 504 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 517 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  36 
 
 		 507 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10990  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  35.39 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  34.69 
 
 		 507 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.5 
 
 		 522 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.05 
 
 		 520 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.37 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  36.26 
 
 		 395 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  33.01 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  31.35 
 
 		 402 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  31.36 
 
 		 437 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  37.55 
 
 		 363 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.06 
 
 		 511 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2937  threonine dehydratase  39.58 
 
 		 418 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  31.73 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.85 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.7 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.79 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1506  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.94 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  38.49 
 
 		 514 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  37.91 
 
 		 411 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>