More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19518 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  100 
 
 		 479 aa  967    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  52.62 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  48.04 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 403 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  39.61 
 
 		 405 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  40.83 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  40.44 
 
 		 403 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  42.82 
 
 		 413 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.01 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  38.59 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  37.28 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  39.01 
 
 		 402 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  41.23 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.11 
 
 		 395 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  41.48 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  41.13 
 
 		 400 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  41.87 
 
 		 415 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 415 aa  259  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.55 
 
 		 418 aa  259  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.28 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  38.27 
 
 		 409 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 400 aa  251  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  41.49 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.06 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 415 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  37.04 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  35.61 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 407 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  41.09 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 415 aa  246  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 411 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.28 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  39.31 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  41.54 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 415 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.6 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.01 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.01 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  37.35 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  36.48 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  37.97 
 
 		 402 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  38.85 
 
 		 425 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  37.12 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  39.01 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  41.38 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  35.03 
 
 		 398 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  38.36 
 
 		 415 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  38.57 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 416 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  39.29 
 
 		 421 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  38.29 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 403 aa  229  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  32.41 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  38.02 
 
 		 402 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  38.19 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  38.42 
 
 		 404 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  37.14 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  38.82 
 
 		 410 aa  226  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 421 aa  226  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  41.28 
 
 		 402 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  36.29 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  40.72 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  32.16 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  40.81 
 
 		 400 aa  223  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  35.27 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  40 
 
 		 346 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  40 
 
 		 346 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  41.54 
 
 		 402 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  37.28 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  38.83 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  39.71 
 
 		 412 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  34.46 
 
 		 406 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  36.63 
 
 		 402 aa  217  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  34.62 
 
 		 408 aa  216  9e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  37.87 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  38.96 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>