More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0227 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0227  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 353 aa  725    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  45.54 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.69 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  43.59 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.08 
 
 		 403 aa  242  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  46.5 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.69 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  40.06 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  42.21 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  45.63 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.85 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  40.13 
 
 		 402 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.59 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  39.81 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  44.63 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.14 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.69 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  40.13 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.44 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.05 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.21 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  46.45 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  43.23 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  42.46 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.03 
 
 		 403 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 400 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 399 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.53 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.1 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  43.41 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  42.09 
 
 		 537 aa  209  4e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.99 
 
 		 403 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.56 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.63 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  44.98 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  45.76 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  45.76 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.69 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  39.48 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.99 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.88 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.56 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  38.34 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  40.71 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  39.48 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.5 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  38.19 
 
 		 400 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.49 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  35.92 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.6 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.99 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.29 
 
 		 315 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 395 aa  198  9e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  42.04 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.34 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  41.05 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.06 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  38.23 
 
 		 514 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  40.2 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  44.37 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  41.75 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.01 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  41.21 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  40.38 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  41.21 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  40.2 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 514 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  35.78 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  36.48 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  44.05 
 
 		 405 aa  192  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  41.42 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2937  threonine dehydratase  44.29 
 
 		 418 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  34.88 
 
 		 509 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  42.95 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 504 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 504 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  39.75 
 
 		 512 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.66 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  40.13 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.76 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  35.9 
 
 		 511 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  38.01 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  38.63 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  38.63 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  39.86 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  37.84 
 
 		 503 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.16 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>