More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0325 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  82.69 
 
 		 285 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  67.48 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  67.25 
 
 		 284 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  67.36 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  63.48 
 
 		 303 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  54.48 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  53.52 
 
 		 338 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50 
 
 		 286 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  48.96 
 
 		 292 aa  222  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  47.5 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  47.87 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  49.27 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  50.18 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  50.36 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  47.22 
 
 		 334 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  49.28 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  48.58 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  45.85 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.77 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  47.52 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  49.12 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  46.86 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.4 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.29 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  45.05 
 
 		 289 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  45.07 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  47.37 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  39.79 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  42.8 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  38.91 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  40.98 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.96 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.01 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.93 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.14 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  44.2 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  43.48 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  44.2 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  44.2 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.65 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  43.14 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  38.96 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  38.1 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36.59 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.19 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.85 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.43 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  42.22 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  38.66 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  37.9 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.76 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  34.57 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.7 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.3 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.38 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.74 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.19 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.1 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  34.84 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  37.56 
 
 		 299 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.36 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.86 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  34.72 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.23 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  35.68 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.25 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.51 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.13 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.09 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.77 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.68 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  35.91 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.94 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.21 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.17 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  40.68 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  31.4 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  36.46 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  32.75 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  34.19 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.94 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  33.93 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  38.01 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  37.8 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.21 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  30.68 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  41.3 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  37.36 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  42.71 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0324  HemK family modification methylase  32.1 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  35.79 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  37.16 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  42.13 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.83 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  36.13 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  38.28 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  42.21 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.55 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.65 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>