More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3319 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  86.27 
 
 
416 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  83.17 
 
 
417 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  100 
 
 
415 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  55.92 
 
 
429 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  55.61 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  55.61 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  56.06 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  58.53 
 
 
386 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  38.5 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  38.5 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  38.5 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  38.64 
 
 
402 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  38.64 
 
 
402 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  38.18 
 
 
387 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  37.56 
 
 
402 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  37.28 
 
 
411 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  37.31 
 
 
402 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  37.06 
 
 
402 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  38.38 
 
 
402 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  37.4 
 
 
402 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  38.38 
 
 
402 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  37.06 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  35.22 
 
 
413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  37.25 
 
 
402 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  35.21 
 
 
411 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  36.17 
 
 
411 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  39.9 
 
 
381 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  39.9 
 
 
381 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  35.32 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  34.07 
 
 
411 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  35.48 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  35.31 
 
 
400 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.52 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.47 
 
 
396 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.74 
 
 
398 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  36.08 
 
 
422 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  34.85 
 
 
403 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  34.7 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  34.45 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  36.5 
 
 
408 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.29 
 
 
399 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  35.75 
 
 
408 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  33.8 
 
 
422 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.26 
 
 
401 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.58 
 
 
406 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  33.93 
 
 
348 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.99 
 
 
403 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.25 
 
 
403 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  32.15 
 
 
348 aa  188  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  32.15 
 
 
348 aa  188  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.9 
 
 
431 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.36 
 
 
403 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.33 
 
 
517 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.9 
 
 
435 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
399 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.38 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  40.38 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  28.54 
 
 
388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.04 
 
 
444 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  29.77 
 
 
440 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.24 
 
 
361 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  32.66 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  33.51 
 
 
399 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  30.28 
 
 
444 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.51 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  29.49 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  29.49 
 
 
383 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  30.53 
 
 
440 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  30.53 
 
 
440 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  28.26 
 
 
496 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  34.22 
 
 
231 aa  136  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.72 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  34.65 
 
 
219 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  28.46 
 
 
383 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  25.37 
 
 
424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  28.21 
 
 
399 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  27.47 
 
 
449 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  29.67 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  27.64 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  27.03 
 
 
370 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  26.44 
 
 
370 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  29.94 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  30.49 
 
 
370 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  29.95 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  27.88 
 
 
396 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.13 
 
 
405 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  30.38 
 
 
391 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  26.77 
 
 
374 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  26.85 
 
 
402 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  26.51 
 
 
370 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  26.05 
 
 
461 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.14 
 
 
362 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  28.37 
 
 
399 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  26.51 
 
 
370 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  27.2 
 
 
384 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  29.32 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>