291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1920 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  74.07 
 
 		 492 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  71.82 
 
 		 463 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  70.31 
 
 		 503 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  66.87 
 
 		 507 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  70.86 
 
 		 495 aa  656    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  66.26 
 
 		 570 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  68.83 
 
 		 483 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  90.93 
 
 		 474 aa  844    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  68.41 
 
 		 483 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 500 aa  1008    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  70.21 
 
 		 482 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.01 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  63.78 
 
 		 529 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  51.59 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  50.32 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  58.05 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  45.59 
 
 		 527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  41.87 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  40.72 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  45.79 
 
 		 539 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  44.55 
 
 		 539 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  39.56 
 
 		 650 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  43.81 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  43.81 
 
 		 538 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 		 257 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  41.24 
 
 		 254 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 254 aa  53.5  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 314 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 286 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 341 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 238 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 255 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 286 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 300 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 247 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.8 
 
 		 251 aa  50.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 265 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 256 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 247 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 254 aa  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 227 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 233 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 289 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.45 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 246 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 239 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.54 
 
 		 306 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 257 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 331 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.55 
 
 		 255 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  31.87 
 
 		 347 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.23 
 
 		 246 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.3 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  39.36 
 
 		 248 aa  48.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  32.29 
 
 		 318 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  35.48 
 
 		 2258 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  35.48 
 
 		 2338 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  35.48 
 
 		 2273 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  35 
 
 		 2137 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  35.48 
 
 		 2287 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 268 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  37.25 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.59 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 335 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  37.11 
 
 		 251 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 253 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 335 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  29.34 
 
 		 265 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 256 aa  47  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>