More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3474 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 836 aa  1654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  67.09 
 
 		 728 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 1192 aa  429  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  43.93 
 
 		 1035 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 1138 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 		 1296 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  43.93 
 
 		 1035 aa  416  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 1055 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  44.78 
 
 		 1410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 1276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 1005 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 1191 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 969 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 1031 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 1149 aa  363  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 1000 aa  360  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  40 
 
 		 1201 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 		 1188 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 981 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 841 aa  268  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  31.75 
 
 		 846 aa  266  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 853 aa  245  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 717 aa  226  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 523 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 773 aa  218  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 531 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 530 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  45.31 
 
 		 532 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 536 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  45.71 
 
 		 513 aa  213  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 530 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  44.49 
 
 		 511 aa  212  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  46.91 
 
 		 511 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 511 aa  213  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 536 aa  211  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 511 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 512 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 798 aa  208  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  40.24 
 
 		 773 aa  204  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 518 aa  201  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 587 aa  201  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 513 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  42.92 
 
 		 470 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 505 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  43.98 
 
 		 513 aa  198  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  43.98 
 
 		 513 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 377 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 844 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 1255 aa  197  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 594 aa  197  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 617 aa  195  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 511 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 468 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 911 aa  192  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 697 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 502 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 389 aa  189  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 784 aa  189  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  41.25 
 
 		 470 aa  188  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 778 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  35.06 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  35.06 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 774 aa  184  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 		 484 aa  183  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 605 aa  183  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 614 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  28.45 
 
 		 774 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 484 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.49 
 
 		 823 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  37.54 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 775 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 769 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1548 aa  178  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 704 aa  177  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 770 aa  177  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  38.06 
 
 		 503 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 475 aa  177  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 1046 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 775 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 513 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  36.82 
 
 		 288 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  31.26 
 
 		 771 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 769 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 371 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 779 aa  172  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1203 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  36.27 
 
 		 771 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 763 aa  171  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 456 aa  171  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  36.1 
 
 		 576 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 627 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1068 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 494 aa  169  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 772 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 607 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1771 aa  168  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1313 aa  168  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>